Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAP1GDS1P52306 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms