Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB28P51157 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB28P51157 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB28P51157 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB28P51157 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB28P51157 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB28P51157 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB28P51157 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB28P51157 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB28P51157 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB28P51157 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB28P51157 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB28P51157 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB28P51157 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB28P51157 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB28P51157 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB28P51157 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB28P51157 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB28P51157 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB28P51157 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB28P51157 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB28P51157 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB28P51157 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB28P51157 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB28P51157 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB28P51157 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB28P51157 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB28P51157 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB28P51157 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB28P51157 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms