Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN2P49810 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms