Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR3P49682 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR3P49682 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR3P49682 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms