Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM4P49221 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM4P49221 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM4P49221 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM4P49221 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM4P49221 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM4P49221 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TGM4P49221 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM4P49221 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM4P49221 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TGM4P49221 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM4P49221 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM4P49221 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM4P49221 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM4P49221 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM4P49221 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM4P49221 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM4P49221 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM4P49221 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM4P49221 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM4P49221 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM4P49221 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM4P49221 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM4P49221 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM4P49221 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM4P49221 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGM4P49221 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms