Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT5P48643 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT5P48643 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT5P48643 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT5P48643 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT5P48643 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT5P48643 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT5P48643 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT5P48643 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT5P48643 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT5P48643 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT5P48643 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT5P48643 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT5P48643 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT5P48643 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT5P48643 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT5P48643 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT5P48643 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT5P48643 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT5P48643 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT5P48643 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT5P48643 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT5P48643 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT5P48643 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT5P48643 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT5P48643 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 449.3 ms