Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREPP48147 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREPP48147 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PREPP48147 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREPP48147 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREPP48147 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREPP48147 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PREPP48147 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PREPP48147 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PREPP48147 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PREPP48147 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PREPP48147 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PREPP48147 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PREPP48147 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PREPP48147 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PREPP48147 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PREPP48147 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREPP48147 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREPP48147 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREPP48147 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREPP48147 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREPP48147 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREPP48147 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PREPP48147 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PREPP48147 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREPP48147 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREPP48147 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREPP48147 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PREPP48147 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREPP48147 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PREPP48147 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms