Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACADSBP45954 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACADSBP45954 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACADSBP45954 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms