Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA4P43681 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA4P43681 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA4P43681 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms