Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VHLP40337 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VHLP40337 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VHLP40337 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VHLP40337 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VHLP40337 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLP40337 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLP40337 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLP40337 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLP40337 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLP40337 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLP40337 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLP40337 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLP40337 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLP40337 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLP40337 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms