Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	GAL4	YPL248C	2646 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	GAT4	YIR013C	366 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.19	□□□□□ -1.74	RIP-Chip
SHE2	P36068	TUB3	YML124C	1338 nt		4.19	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	ESF1	YDR365C	1887 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	MLC1	YGL106W	450 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	ATP14	YLR295C	375 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YPL199C	YPL199C	723 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	TOM5	YPR133W-A	153 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	COT1	YOR316C	1320 nt		4.18	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	AKL1	YBR059C	3327 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	RSC30	YHR056C	2652 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YGR122W	YGR122W	1209 nt		4.17	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	MSS116	YDR194C	1995 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	APE1	YKL103C	1545 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	CAB4	YGR277C	918 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	FMP33	YJL161W	543 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	BUD28	YLR062C	378 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	SER1	YOR184W	1188 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YPL113C	YPL113C	1191 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.16	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.15	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	KNH1	YDL049C	807 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YNL194C	YNL194C	906 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	CSL4	YNL232W	879 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	THI20	YOL055C	1656 nt		4.15	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	APC4	YDR118W	1959 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YMR196W	YMR196W	3267 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	LYS5	YGL154C	819 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	NAT2	YGR147C	867 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	SLZ1	YNL196C	897 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	GIP1	YBR045C	1920 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	AIM10	YER087W	1731 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	ABF1	YKL112W	2196 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.14	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	SER33	YIL074C	1410 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	TSL1	YML100W	3297 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	TEA1	YOR337W	2280 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	RSM10	YDR041W	612 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	DCD1	YHR144C	939 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	CKB2	YOR039W	777 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	CAR1	YPL111W	1002 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	snR19	snR19	568 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	BUD7	YOR299W	2241 nt		4.13	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	TRM44	YPL030W	1704 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YNG2	YHR090C	849 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	PRE7	YBL041W	726 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	MET4	YNL103W	2019 nt		4.12	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
SHE2	P36068	YLH47	YPR125W	1365 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	TFG1	YGR186W	2208 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	HIR2	YOR038C	2628 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	ALG2	YGL065C	1512 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	SKI6	YGR195W	741 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YAP1802	YGR241C	1707 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YJR015W	YJR015W	1533 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	DON1	YDR273W	1098 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	GPI12	YMR281W	915 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YNL134C	YNL134C	1131 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	SMA1	YPL027W	738 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	URA7	YBL039C	1740 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	STR2	YJR130C	1920 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	FAA4	YMR246W	2085 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	PER1	YCR044C	1074 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	RNA15	YGL044C	891 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	ORM1	YGR038W	669 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SHE2	P36068	RFT1	YBL020W	1725 nt		4.09	□□□□□ -1.76
SHE2	P36068	SUM1	YDR310C	3189 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SHE2	P36068	ARG82	YDR173C	1068 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SHE2	P36068	CNL1	YDR357C	369 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SHE2	P36068	SNA2	YDR525W-A	240 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SHE2	P36068	LEU1	YGL009C	2340 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SHE2	P36068	CDC42	YLR229C	576 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SHE2	P36068	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.08	□□□□□ -1.76

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