Protein–RNA interactions for Protein: P32380

SPC110, Spindle pole body component 110, yeastyeast

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC110P32380 UGA2YBR006W 1494 nt5.35□□□□□ -1.55
SPC110P32380 UPS3YDR185C 540 nt5.35□□□□□ -1.55
SPC110P32380 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.35□□□□□ -1.55
SPC110P32380 YNL194CYNL194C 906 nt5.35□□□□□ -1.55
SPC110P32380 ELC1YPL046C 300 nt5.35□□□□□ -1.55
SPC110P32380 MAK3YPR051W 531 nt5.35□□□□□ -1.55
SPC110P32380 SKG3YLR187W 3081 nt5.34□□□□□ -1.55
SPC110P32380 MMT2YPL224C 1455 nt5.34□□□□□ -1.55
SPC110P32380 CLB4YLR210W 1383 nt5.34□□□□□ -1.55
SPC110P32380 PRT1YOR361C 2292 nt5.34□□□□□ -1.55
SPC110P32380 SRG1SRG1 551 nt5.34□□□□□ -1.55
SPC110P32380 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.34□□□□□ -1.55
SPC110P32380 TRM10YOL093W 882 nt5.34□□□□□ -1.55
SPC110P32380 YMR102CYMR102C 2505 nt5.34□□□□□ -1.56
SPC110P32380 KRS1YDR037W 1776 nt5.34□□□□□ -1.56
SPC110P32380 TPO2YGR138C 1845 nt5.33□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YEL045CYEL045C 426 nt5.33□□□□□ -1.56
SPC110P32380 PRM10YJL108C 1152 nt5.33□□□□□ -1.56
SPC110P32380 BBP1YPL255W 1158 nt5.33□□□□□ -1.56
SPC110P32380 NHP6AYPR052C 282 nt5.33□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MRL1YPR079W 1146 nt5.33□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YEF1YEL041W 1488 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 BSC5YNR069C 1470 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 BOP2YLR267W 1713 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MPS3YJL019W 2049 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MRS3YJL133W 945 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MED4YOR174W 855 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MNN1YER001W 2289 nt5.32□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YPL245WYPL245W 1365 nt5.31□□□□□ -1.56
SPC110P32380 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.31□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.31□□□□□ -1.56
SPC110P32380 ERG3YLR056W 1098 nt5.31□□□□□ -1.56
SPC110P32380 TAF11YML015C 1041 nt5.31□□□□□ -1.56
SPC110P32380 JEM1YJL073W 1938 nt5.31□□□□□ -1.56
SPC110P32380 CDS1YBR029C 1374 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 APE1YKL103C 1545 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 CDC15YAR019C 2925 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 DAM1YGR113W 1032 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 CWC25YNL245C 540 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YPR150WYPR150W 522 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MEC3YLR288C 1425 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 PAN1YIR006C 4443 nt5.3□□□□□ -1.56
SPC110P32380 FRS1YLR060W 1788 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 HXT4YHR092C 1731 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 CLA4YNL298W 2529 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 BCP1YDR361C 852 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YGR153WYGR153W 654 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 GSP2YOR185C 663 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 SKG6YHR149C 2205 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 VID22YLR373C 2706 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 SDA1YGR245C 2304 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YTA12YMR089C 2478 nt5.29□□□□□ -1.56
SPC110P32380 RRN11YML043C 1524 nt5.28□□□□□ -1.56
SPC110P32380 LEU1YGL009C 2340 nt5.28□□□□□ -1.56
SPC110P32380 AIR2YDL175C 1035 nt5.28□□□□□ -1.56
SPC110P32380 YMR085WYMR085W 1299 nt5.28□□□□□ -1.56
SPC110P32380 ADD37YMR184W 597 nt5.28□□□□□ -1.56
SPC110P32380 MDG1YNL173C 1101 nt5.28□□□□□ -1.56
SPC110P32380 KIC1YHR102W 3243 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 GIP1YBR045C 1920 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 YDL124WYDL124W 939 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 YDR134CYDR134C 411 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 GSM1YJL103C 1857 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 MTF1YMR228W 1026 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 YOL153CYOL153C 1746 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 PDR10YOR328W 4695 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 STE12YHR084W 2067 nt5.27□□□□□ -1.57
SPC110P32380 VID30YGL227W 2877 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 THS1YIL078W 2205 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 RRP1YDR087C 837 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 RTT103YDR289C 1230 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 ASP1YDR321W 1146 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 CSR1YLR380W 1227 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 IMP2YMR035W 534 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 PRE2YPR103W 864 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 EGT2YNL327W 3126 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 PHO84YML123C 1764 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 CDC48YDL126C 2508 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 FRE7YOL152W 1863 nt5.26□□□□□ -1.57
SPC110P32380 YIL092WYIL092W 1902 nt5.25□□□□□ -1.57
SPC110P32380 PUS6YGR169C 1215 nt5.25□□□□□ -1.57
SPC110P32380 TOM7YNL070W 183 nt5.25□□□□□ -1.57
SPC110P32380 YNL174WYNL174W 573 nt5.25□□□□□ -1.57
SPC110P32380 IZH3YLR023C 1632 nt5.25□□□□□ -1.57
SPC110P32380 TGL4YKR089C 2733 nt5.25□□□□□ -1.57
SPC110P32380 CAB4YGR277C 918 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 CUE5YOR042W 1236 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 COA2YPL189C-A 207 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 SAP155YFR040W 3009 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 LCB2YDR062W 1686 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 HIR2YOR038C 2628 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 FAA4YMR246W 2085 nt5.24□□□□□ -1.57
SPC110P32380 CAB3YKL088W 1716 nt5.23□□□□□ -1.57
SPC110P32380 MCM4YPR019W 2802 nt5.23□□□□□ -1.57
SPC110P32380 FAU1YER183C 636 nt5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms