Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXA7P31268 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA7P31268 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms