Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-FP30511 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-FP30511 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms