Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB2P26583 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HMGB2P26583 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms