Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DNMT1P26358 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DNMT1P26358 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms