Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP100P23497 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP100P23497 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP100P23497 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SP100P23497 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP100P23497 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP100P23497 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP100P23497 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP100P23497 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP100P23497 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP100P23497 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP100P23497 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP100P23497 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP100P23497 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP100P23497 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP100P23497 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP100P23497 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SP100P23497 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP100P23497 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP100P23497 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP100P23497 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms