Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GM2AP17900 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GM2AP17900 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GM2AP17900 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GM2AP17900 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GM2AP17900 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GM2AP17900 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GM2AP17900 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GM2AP17900 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GM2AP17900 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GM2AP17900 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GM2AP17900 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GM2AP17900 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GM2AP17900 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GM2AP17900 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms