Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF7P17544 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF7P17544 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF7P17544 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF7P17544 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF7P17544 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF7P17544 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF7P17544 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF7P17544 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF7P17544 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7P17544 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7P17544 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7P17544 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF7P17544 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7P17544 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7P17544 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7P17544 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF7P17544 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms