Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCFC2P16383 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GCFC2P16383 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms