Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP2C9P11712 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C9P11712 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C9P11712 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms