Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ESRRAP11474 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms