Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
LAMC1P11047 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMC1P11047 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms