Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPD1P10809 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPD1P10809 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPD1P10809 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms