Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L1P0DMW3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L1P0DMW3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms