Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms