Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M6

IQCF3, IQ domain-containing protein F3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF3P0C7M6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF3P0C7M6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IQCF3P0C7M6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms