Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC4P09017 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC4P09017 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms