Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPM2P07951 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPM2P07951 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPM2P07951 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPM2P07951 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPM2P07951 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TPM2P07951 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM2P07951 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM2P07951 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM2P07951 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM2P07951 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPM2P07951 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPM2P07951 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM2P07951 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM2P07951 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM2P07951 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM2P07951 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM2P07951 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM2P07951 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPM2P07951 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM2P07951 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM2P07951 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM2P07951 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM2P07951 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPM2P07951 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM2P07951 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM2P07951 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM2P07951 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM2P07951 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM2P07951 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM2P07951 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPM2P07951 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TPM2P07951 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM2P07951 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM2P07951 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM2P07951 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM2P07951 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM2P07951 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPM2P07951 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM2P07951 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM2P07951 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM2P07951 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPM2P07951 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPM2P07951 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM2P07951 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM2P07951 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM2P07951 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM2P07951 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM2P07951 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPM2P07951 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM2P07951 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM2P07951 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM2P07951 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM2P07951 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPM2P07951 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM2P07951 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM2P07951 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM2P07951 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM2P07951 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms