Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBBP07437 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBBP07437 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBBP07437 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBBP07437 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBBP07437 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBBP07437 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBBP07437 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBBP07437 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TUBBP07437 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBBP07437 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBBP07437 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBBP07437 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBBP07437 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBBP07437 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBBP07437 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBBP07437 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBBP07437 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBBP07437 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBBP07437 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBBP07437 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBBP07437 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBBP07437 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBBP07437 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBBP07437 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBBP07437 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBBP07437 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBBP07437 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBBP07437 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBBP07437 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBBP07437 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBBP07437 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBBP07437 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBBP07437 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBBP07437 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBBP07437 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBBP07437 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBBP07437 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBBP07437 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBBP07437 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBBP07437 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBBP07437 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBBP07437 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms