Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPIND1P05546 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPIND1P05546 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms