Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOD2P04179 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOD2P04179 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOD2P04179 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOD2P04179 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOD2P04179 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOD2P04179 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD2P04179 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD2P04179 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD2P04179 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD2P04179 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD2P04179 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD2P04179 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD2P04179 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD2P04179 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD2P04179 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD2P04179 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD2P04179 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD2P04179 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD2P04179 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms