Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP1P01033 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP1P01033 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms