Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF6BO95407 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms