Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DKK1O94907 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK1O94907 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK1O94907 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DKK1O94907 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK1O94907 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK1O94907 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK1O94907 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK1O94907 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK1O94907 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DKK1O94907 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DKK1O94907 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
DKK1O94907 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DKK1O94907 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DKK1O94907 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK1O94907 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK1O94907 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK1O94907 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK1O94907 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK1O94907 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK1O94907 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK1O94907 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DKK1O94907 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK1O94907 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK1O94907 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK1O94907 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK1O94907 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK1O94907 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK1O94907 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK1O94907 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms