Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG2O94898 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms