Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP72O76094 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP72O76094 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP72O76094 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP72O76094 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP72O76094 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP72O76094 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP72O76094 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP72O76094 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP72O76094 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP72O76094 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP72O76094 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP72O76094 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP72O76094 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP72O76094 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP72O76094 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP72O76094 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP72O76094 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP72O76094 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP72O76094 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms