Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KATNA1O75449 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KATNA1O75449 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KATNA1O75449 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KATNA1O75449 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KATNA1O75449 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KATNA1O75449 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KATNA1O75449 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KATNA1O75449 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms