Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9AO75110 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9AO75110 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms