Protein–RNA interactions for Protein: O60902

SHOX2, Short stature homeobox protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOX2O60902 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOX2O60902 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHOX2O60902 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms