Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1O43719 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1O43719 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms