Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B1O43520 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms