Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTIFO43310 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTIFO43310 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTIFO43310 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTIFO43310 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTIFO43310 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTIFO43310 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTIFO43310 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTIFO43310 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTIFO43310 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTIFO43310 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTIFO43310 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTIFO43310 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTIFO43310 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTIFO43310 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTIFO43310 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTIFO43310 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTIFO43310 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTIFO43310 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTIFO43310 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTIFO43310 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTIFO43310 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTIFO43310 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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