Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP3O14828 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms