Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDC80O14777 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC80O14777 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC80O14777 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC80O14777 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC80O14777 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDC80O14777 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDC80O14777 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDC80O14777 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDC80O14777 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDC80O14777 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDC80O14777 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC80O14777 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC80O14777 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC80O14777 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC80O14777 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC80O14777 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDC80O14777 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDC80O14777 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDC80O14777 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDC80O14777 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NDC80O14777 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms