Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFRD1O00458 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFRD1O00458 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFRD1O00458 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms