Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms