Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFI1A8K8P3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SFI1A8K8P3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms