Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00862A6NCI5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00862A6NCI5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms