Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms